据当地媒体报道，作为东非地区最大港口，肯尼亚蒙巴萨港集装箱吞吐量每年达60万箱，每天装卸2000箱。但由于该港口管理存在很多瓶颈以及装卸能力远低于运输需求，港口货物大量积压，卢旺达进口货物纷纷转向坦桑尼亚达累斯萨拉姆港中转。据悉，由蒙巴萨港进口一辆小汽车所花费的港口费用要比从达累港进口高出500美元，而原先驻蒙巴萨港的卢旺达清关运输代理公司有80%转到了达累港。

　　蒙巴萨港每年进口集装箱40万箱，出口集装箱20万箱，2011年进口箱数还增长了20%，而今年只有4%。肯尼亚将于2013年3月4日起大选，贸易商担心大选引起的骚乱会给货物运输带来损失。因此，蒙巴萨港集装箱量将会继续减少。肯尼亚政府已和日本计划在蒙巴萨港共建一个新的集装箱码头解决装卸能力不足问题。