2013年上海港国际航行船舶吞吐量同比略有下降，不过由于中国（上海）自贸区建设的拉动作用，上海市各主要港口成绩依然引人瞩目，外高桥港各项指标在全国均名列前茅。

据上海边检部门统计，2013年上海港国际航行船舶吞吐量3.8万艘次，同比减少14.3%，外高桥边检站辖区内的外高桥港，2013年度共检查出入境（港）的国际航行船舶21779艘次，同比略降0.86%；检查出入境（港）人员448410人次，同比下降0.10%。外高桥港区出入境船舶及人员的降幅远远低于上海港的总体降幅，这可能是由于中国（上海）自贸区建设的利好和刺激。

据洋山边检站统计，洋山深水港2013年共出入国际航行船舶9446艘次，同比下降3.2%，出入人员22.8万人次，同比下降1.8%。边检民警告诉记者，随着全球经济逐步缓慢复苏，海运需求正稳步提升，使得国际大型航运公司运力不断投放。去年，航运巨头马士基旗下全球新一代最大集装箱轮“马士基迈克凯尼穆勒”选择在洋山港首航，大船下水日趋频繁。

此外，去年7月1日《中华人民共和国出境入境管理法》正式施行，上海边检部门对部分服务举措依法进行了调整，推出了“临时入境许可”制度，分别在外高桥、洋山口岸签发临时入境许可32509、14844份，为国际海员的出入境提供了极大的便利，收到了中外船员、航运公司及代理公司的高度好评。