台北市士林地检署侦办台南舰弊案，出现重大进展，办案人员于三月间登舰履勘后，确认甲板载重量不足，无法提供直升机起降，台“海巡署”疑放水让负责设计的财团法人船舶暨海洋产业研发中心过关，图利3300万元（新台币，下同），全案已转侦字案，往贪污治罪条例方向侦办。时任“海洋巡防总局副总局长”的黄淦甫、船务组长黄汉松及监造科长吴瑞祥3人皆列被告，遭限制住居。

据报道，台北检方于三、四月间，前往左营履勘台南舰，发现当初设计用来停放十吨重的黑鹰直升机，飞行甲板结构却有问题，载重力仅5公吨，明显不足。另办案人员也发现，直升机甲板必须距障碍物2公尺以上，以黑鹰直升机而言，台南舰的甲板空间不足以让相关人员在甲板上活动、协助起降。

本案案由原为违反“政府采购法”，检调当时仅认为，“海巡署”人员针对台南舰验收时，程序未完备，导致公币遭浪费，然而在比对合约后，发现若甲板不符规格，负责设计的船舶暨海洋产业研发中心，必须减价3千3百万元，但“海巡署”并未依乔纳回退款，疑似涉嫌图利。